EYES队探测到奇里亚星人的生物反应后赶往现场，用威吓弹暂时阻止了暴走的奇里亚星人，让其暂时恢复了平静。在从村民那里得知了奇里亚星人的所作所为后，EYES队等人也决定要伸出援手。
之后，奇里亚星人为了保护村民而再次冒险吸收毒物，不可避免的再度暴走。受到奇里亚星人嘱托的春野武藏变身为高斯·奥特曼登场，阻止狂化的外星人。暴走的奇里亚星人压制了月神模式的高斯·奥特曼，并焚烧雾隐山。后来，高斯·奥特曼变身为日蚀模式，以压倒性的战力击败了奇里亚星人，并以「克兹缪姆光线」净化了奇里亚星人体内的毒物。随后，高斯·奥特曼日蚀更将所有的宇宙之花花粉发送到宇宙空间中消灭，彻底解决了毒物的威胁。奇里亚星人恢复自我，继续以山野先生的身份留在雾隐村里生活。
阿尔克拉，是神秘的宇宙生物“雪之星”进行变态发育前的姿态，为了完成发育而来到地球，在R2地区的森林地带中出现，径直前往市街区，途中还不断放射出爆破光弹，破坏了树林和街区建筑。EYES队赶来阻止阿尔克拉前进，在被麻醉弹击中后不久，阿尔克拉就倒地不起。
阿尔克拉的倒地，并不是因为麻醉弹，而是其体内细胞的自我摧毁，使得生命力逐渐下降，趋近于死亡。由于阿尔克拉的破坏力，EYES队通过交涉后勉强和防卫军达成共识，让阿尔克拉待在原地直至死亡，期间EYES只负责驻守但不攻击。然而，阿尔克拉在「细胞凋亡」过程中一时间回光返照，生命力提升而苏醒，并继续释放出爆破光弹进行破坏。EYES队没有办法，只能对阿尔克拉进行格杀。
春野武藏变身为高斯·奥特曼出现，阻止了EYES的攻击，并和暴躁的阿尔克拉展开战斗。一番格斗战后，阿尔克拉的生命力再度耗尽而倒下，最终完成了分裂变态发育，化为了无数的“雪之星”。由于“雪之星”是吞食放射性废弃物的有益生物，“雪之星”没受到攻击，最终飞向了遥远的宇宙。
天敌怪兽马萨尔加斯，是一种能捕食光之病毒·卡欧斯头部的怪兽，它体内的「卡欧斯嵌合体」酵素能够分解消化卡欧斯头部，并化为能源供它自己活动。因此，马萨尔加斯在宇宙中四处追逐着卡欧斯头部，向地球飞来。当卡欧斯头部在芹泽新区建筑预定地出现时，马萨尔加斯也变形为陨石状抵达了现场，随后开始捕食行动。卡欧斯头部无法附身马萨尔加斯，还反被怪兽吸收了一部分能源，于是立刻逃走，马萨尔加斯也下潜到地层中隐藏。
TEAM EYES解析了马萨尔加斯的身体，发现了「卡欧斯嵌合体」酵素的存在，制定计划要捕获怪兽。卡欧斯头部为了解决掉马萨尔加斯这一天敌，故意把一直追着自己的怪兽引到了防卫军的弹药库附近。EYES展开捕获作战，但抑制弹的药效被马萨尔加斯无效化，镭射栅栏的能源被吸收，两架战斗机也都被怪兽击落。捕获失败，马萨尔加斯闯入了弹药库，防卫军准备动用怪兽歼灭兵器「特比地斯909」导弹将其消灭。春野武藏变身为高斯·奥特曼登场，阻拦马萨尔加斯。但防卫军趁着交战时发射导弹击中了马萨尔加斯，将怪兽体内的「卡欧斯嵌合体」酵素细胞彻底摧毁。马萨尔加斯奄奄一息，被卡欧斯头部趁机附身，变异成为卡欧斯马萨尔加斯。
面对狂暴的卡欧斯马萨尔加斯，高斯·奥特曼接连切换日冕模式、日蚀模式迎战，最终将怪兽体内的卡欧斯头部逐出并消灭，让马萨尔加斯变回原状。但马萨尔加斯体内的细胞早已被防卫军全部摧毁，最终倒地身亡，尸体被高斯·奥特曼送回了宇宙。
古罗西那，10年前曾经在骏河湾出现被GUTS（胜利队）打败，以假死状态伪装自己，隐藏在位于中部山坳的地底中。后来宇宙寄生兽塞克洛美特拉寄生于其体内，因此变得凶暴无比，外形看起来非常强壮。由于飞鸟的骄傲自大和鲁莽行事导致喜比队长驾驶的胜利神鹰号被古罗西那击落，喜比队长因此身负重伤。
而后被飞鸟放出的诱导电波引诱出现在地面上，超级胜利队用激光光绳捆住了它的双手，狩矢驾驶伽马号发射破坏光线将古罗西那的脖子打伤想要消灭塞克洛美特拉但失败了，古罗西那挣脱了激光绳后实力大幅度的提升，将超级胜利队的武器装备全部破坏，再一次击落了来支援飞鸟的喜比队长驾驶的阿尔法号，关键时刻飞鸟信成功变身戴拿及时救下了即将坠毁的阿尔法号。
戴拿与古罗西那展开激烈的战斗。古罗西那能够从口中吐出红色的强光线，破坏力非常强，两手长有锐利的爪子，寄生在古罗西那体中的塞克洛美特拉可以令其伤口再生。尾巴能够缠住戴拿的脖子释放红色的强力电流，力量非常强大，最后戴拿奥特曼经过了一番苦战后以「索尔捷特光线」将古罗西那的脖子击穿，并使用「闪亮光弹」消灭了塞克洛美特拉后古罗西那无法再生彻底死亡。
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